Независими от културата диагностични тестове - Безопасност на храните

Какво представляват CIDT и как влияят на храносмилателната болест?

CIDT позволяват на лекарите бързо да установят причината за заболяването на пациента. Тези тестове обаче не предоставят необходимата информация за намиране и предотвратяване на огнища на болести, пренасяни от храната, и следене на тенденциите на заболяванията.

Независимите от културата диагностични тестове (CIDT) променят начина, по който клиничните лаборатории диагностицират пациенти с хранителни заболявания. Тези тестове могат да идентифицират общия тип бактерии, причиняващи заболяване в рамките на часове, без да се налага култивиране или отглеждане на бактериите в лаборатория. (Чистият бактериален щам, който расте, се нарича изолат.) Тези тестове позволяват на лекарите бързо да установят причината за заболяването на пациента. Преминаването към CIDT обаче означава, че клиничните лаборатории могат да спрат култивирането или производството на бактериални изолати от пациенти с храносмилателни заболявания. Например процентът на заболявания на диария Campylobacter, диагностицирани само от CIDTs в сайтове на FoodNet, се увеличи от 13% през 2012-2014 г. до 38% през 2018 г.

Без бактериален изолат от процеса на култивиране, учените в областта на общественото здраве не могат да извършват тестове, които определят щама или подтипа на организма (като ДНК пръстови отпечатъци), образец на резистентност или други характеристики. Тази информация е необходима за откриване и предотвратяване на огнища, проследяване на антибиотичната резистентност и следене на тенденциите на заболяванията, за да се знае дали мерките за превенция действат.

Как CIDT влияят върху способността на служителите в общественото здравеопазване да откриват и предотвратяват огнища?

Микробиолог използва цялостно секвенциране на генома, за да определи ДНК отпечатъка на бактериите, които са разболели някого.

• PulseNet, лабораторна мрежа, която свързва случаи на болести, пренасяни с храната, за откриване на огнища, извлича важна информация от бактериите, които се намират в проби от болни хора.
• PulseNet се нуждае от бактериални изолати, за да определи точните щамове, които разболяват хората, използвайки методите на ДНК отпечатъци, включително нов точен метод, известен като секвенция на целия геном (WGS).
• Служителите на общественото здраве разглеждат данните на PulseNet за групи от съвпадащи отпечатъци на ДНК. Ако епидемиолозите установят, че клъстерът има общ източник, той се нарича огнище.
• CIDT пропускат стъпката на получаване на изолат и в резултат ДНК отпечатъци не могат да бъдат произведени за PulseNet. Без отпечатъци от ДНК от бактериите, PulseNet няма да може да продължи да открива клъстери.
• Без откриване на клъстери PulseNet е възможно огнища дори да не бъдат разпознати, замърсените продукти могат да останат по рафтовете и в килерите, повече хора могат да се разболеят и може да се загубят ценни възможности за подобряване на безопасността на храната ни.
• PulseNet предотвратява приблизително 270 000 заболявания всяка година и спестява около 507 милиона долара всяка година на медицински разходи и загубена производителност.

Как CIDT влияят върху способността за проследяване и задържане на антибиотична резистентност?

• Служителите на общественото здраве събират информация за антибиотичната резистентност, като анализират бактериални изолати, след като се отглеждат в култура.
• Ако не са налични култивирани бактериални изолати за анализ, няма да знаем доколко са устойчиви на антибиотици. Това може да повлияе на лечението на заболяването и да затрудни наблюдението на тенденциите на резистентност във времето.
• Мониторингът на антибиотичната резистентност понякога води до регулаторни действия за защита на здравето, като например забраната на употребата на флуорохинолон външна икона в домашните птици, след като научните данни показват, че употребата му причинява увеличаване на антибиотично резистентния Campylobacter, който причинява болести, пренасяни от храната.

Това изображение показва последния етап от процеса на бактериална култура. Струпвания от чисти бактерии или бактериални изолати растат върху култура или петри.

Как CIDT влияят върху способността да се наблюдават тенденциите на заболяванията?

• CIDT може да подобри способността ни да наблюдаваме определени видове тенденции на болести, като например заболявания, причинени от бактерии, вируси или паразити, за които преди това не са били налични практически тестове.

• CIDT не произвеждат бактериални изолати, които са необходими за разграничаване между щамове и подтипове бактерии. Следователно служителите в общественото здравеопазване не са в състояние да проследят важни промени в честотата на заболяванията, причинени от специфични видове бактерии.

  • Това също ограничава възможността за откриване, разследване и контрол на многостъпални огнища.
  • Регулаторните агенции и отрасли се нуждаят от информация от разследвания на огнища и тенденции на заболяване, за да предприемат действия, за да направят храната по-безопасна.

Най-горе на страницата

Потенциални краткосрочни решения

1. CDC насърчава клиничните лаборатории да работят с лаборатории за обществено здраве, за да продължат да култивират и изолират вредните бактерии от болни хора с положителни CIDT. Пациентските проби с положителен CIDT за салмонела, Shiga, произвеждащи токсини E. coli и Shigella трябва да се култивират, за да се изолират бактериалния щам. Избраните лаборатории също трябва да направят това за Campylobacter.
2. CDC обмисля начини да направи културите за проследяване по-лесни и по-евтини за клиничните лаборатории.
3. CDC работи в тясно сътрудничество с Асоциацията на лабораториите за обществено здраве (APHL), служителите в общественото здравеопазване, регулаторните агенции, диагностичните лаборатории, производителите на CIDT комплекти и клиницистите, за да се уверят, че културите се получават в клинични лаборатории, когато CIDT са положителни или положителни пробата от пациента се предоставя на лаборатории за обществено здраве, за да могат да го култивират.
4. CDC насърчава компаниите, които правят CIDT, да проектират тестовете по начин, който поддържа бактериите живи, така че да могат да бъдат култивирани, ако тестът е положителен.
5. CDC адаптира системи за наблюдение като мрежа за активно наблюдение на болести, пренасяни от храната или FoodNet, за да включва инфекции, диагностицирани само от CIDT.

Потенциални дългосрочни решения

CDC работи с партньори, за да разработи съвременни методи за тестване, които няма да изискват бактериални изолати за предоставяне на информация, необходима на служителите в общественото здравеопазване. Тези тестове могат също така да предоставят допълнителна информация на доставчиците на здравни грижи за потенциала на зародиша за антибиотична резистентност или вероятността да причини сериозно заболяване

Тези иновации са в ранните етапи на развитие и могат да бъдат далеч от прилагането им. Изследователите се надяват, че използването на тези методи в крайна сметка ще премахне необходимостта от култивиране на бактериални изолати от повечето пациенти и ще ускори процеса на откриване и разрешаване на огнища. Бактериални изолати, получени от култура от пациенти, все още ще са необходими за дълго време, за да се идентифицират възникващите проблеми.

Най-горе на страницата

Научете повече

• Диагностични тестове за болести и независими от културата
• Бъдещето на PulseNet

Свързани публикации

• „Инфекция с патогени, предавани често чрез храната и ефекта от все по-голямо използване на независими от културата диагностични тестове за наблюдение - мрежа за активно наблюдение на хранителни заболявания, 10 американски сайта, 2012–2015 г.“: Седмичен доклад за заболеваемост и смъртност
• „Икономическа оценка на PulseNet” външна икона: Американски журнал за превантивна медицина
• „Прилагане на национално разделяне в реално време на целия геном за подобряване на откриването и изследването на листериозата“клинични инфекциозни заболявания
• „Ефект на диагностичните тестове, независими от културата, върху наблюдението на бъдещите зараждащи се инфекции“: статия в списанието за възникващи инфекциозни заболявания
• „Бактериални ентерични инфекции, открити чрез независими от културата диагностични тестове - FoodNet, Съединени щати, 2012-2014“: Седмичен доклад за заболеваемост и смъртност