CDC събира данни от всички състояния за инфекции, дължащи се на ендогенни бактериални патогени, които се поддават на информация, включително Listeria monocytogenes, Salmonella spp, Shiga-продуцираща токсин Escherichia coli (STEC), Shigella spp и Vibrio spp (включително V. cholerae). CDC също събира данни от всички състояния за случаи на ботулизъм, който се причинява от токсини, произведени от Clostridium botulinum; ботулизмът също е национално известяващ. Информацията се събира както от „лабораторни“, така и от „базирани на конкретни случаи“системи за наблюдение.
Национално лабораторно наблюдение
„Лабораторно-базираното“наблюдение разчита на събирането на информация за бактериите, които са били идентифицирани чрез лабораторни изследвания на болни. Бактериите се изолират и идентифицират от пациентски проби от клинични лаборатории, а изолатите след това се предават на държавните лаборатории за обществено здраве за допълнителна характеристика или се докладват за тях. CDC извършва лабораторно наблюдение за инфекции, причинени от Salmonella, Shigella и Shiga токсин, произвеждащи Escherichia coli (STEC), като използва доклади от държавни и териториални лаборатории за обществено здраве.